Signal Peptide Database - Bacteria

 Entry Details
ID   772
Source Database   UniProtKB/Swiss-Prot
UniProtKB/Swiss-Prot Accession Number   Q9KI14    (Created: 2007-09-11 Updated: 2008-11-25)
UniProtKB/Swiss-Prot Entry Name   SDRF_STAEP
Protein Name   Serine-aspartate repeat-containing protein F
Gene   sdrF
Organism Scientific   Staphylococcus epidermidis
Organism Common  
Lineage   Bacteria
  Firmicutes
    Bacillales
      Staphylococcus
Protein Length [aa]   1733
Protein Mass [Da]   184723
Features  
TypeDescriptionStatusStartEnd
signal peptide      potential   1   45
chain   Serine-aspartate repeat-containing protein F      46   1697
domain   CNA-B 1      679   797
domain   CNA-B 2      798   907
domain   CNA-B 3      908   1018
domain   CNA-B 4      1019   1129
region of interest   Ligand binding A region      46   678
region of interest   Type I collagen binding region      679   1129
modified residue   Pentaglycyl murein peptidoglycan amidated threonine   potential   1697   1697
propeptide   Removed by sortase   potential   1698   1733
compositionally biased region   Asp/Ser-rich      1130   1687
short sequence motif   LPXTG sorting signal   potential   1694   1698
SP Length   45
 ----+----1----+----2----+----3----+----4----+----5
Signal Peptide MKKRRQGPINKRVDFLSNKVNKYSIRKFTVGTASILVGATLMFGA
Sequence MKKRRQGPINKRVDFLSNKVNKYSIRKFTVGTASILVGATLMFGAADNEA
KAAEDNQLESASKEEQKGSRDNENSKLNQVDLDNGSHSSEKTTNVNNATE
VKKVEAPTTSDVSKPKANEAVVTNESTKPKTTEAPTVNEESIAETPKTST
TQQDSTEKNNPSLKDNLNSSSTTSKESKTDEHSTKQAQMSTNKSNLDTND
SPTQSEKTSSQANNDSTDNQSAPSKQLDSKPSEQKVYKTKFNDEPTQDVE
HTTTKLKTPSVSTDSSVNDKQDYTRSAVASLGVDSNETEAITNAVRDNLD
LKAASREQINEAIIAEALKKDFSNPDYGVDTPLALNRSQSKNSPHKSASP
RMNLMSLAAEPNSGKNVNDKVKITNPTLSLNKSNNHANNVIWPTSNEQFN
LKANYELDDSIKEGDTFTIKYGQYIRPGGLELPAIKTQLRSKDGSIVANG
VYDKTTNTTTYTFTNYVDQYQNITGSFDLIATPKRETAIKDNQNYPMEVT
IANEVVKKDFIVDYGNKKDNTTTAAVANVDNVNNKHNEVVYLNQNNQNPK
YAKYFSTVKNGEFIPGEVKVYEVTDTNAMVDSFNPDLNSSNVKDVTSQFA
PKVSADGTRVDINFARSMANGKKYIVTQAVRPTGTGNVYTEYWLTRDGTT
NTNDFYRGTKSTTVTYLNGSSTAQGDNP
TYSLGDYVWLDKNKNGVQDDDE
KGLAGVYVTLKDSNNRELQRVTTDQSGHYQFDNLQNGTYTVEFAIPDNYT
PSPANNSTNDAIDSDGERDGTRKVVVAKGTINNADNMTVDTGFYLTPKYN
VGDYVWEDTNKDGIQDDNEKGISGVKVTLKNKNGDTIGTTTTDSNGKYEF
TGLENGDYTIEFETPEGYTPTKQNSGSDEGKDSNGTKTTVTVKDADNKTI
DSGFYKPTYNLGDYVWEDTNKDGIQDDSEKGISGVKVTLKDKNGNAIGTT
TTDASGHYQFKGLENGSYTVEFETPSGYTPTKANSGQDITVDSNGITTTG
IINGADNLTIDSGFYKTPKYSVGDYVWEDTNKDGIQDDNEKGISGVKVTL
KDEKGNIISTTTTDENGKYQFDNLDSGNYIIHFEKPEGMTQTTANSGNDD
EKDADGEDVRVTITDHDDFSIDNGYFDDD
SDSDSDADSDSDSDSDSDADS
DSDADSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDS
DADSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDS
DADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDADSDADSDSDADSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADS
DSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
KNAKDKLPDTGAN
EDHDSKGTLLGTLFAGLGALLLGRRRKKDNKEK
Original MKKRRQGPINKRVDFLSNKVNKYSIRKFTVGTASILVGATLMFGAADNEA
KAAEDNQLESASKEEQKGSRDNENSKLNQVDLDNGSHSSEKTTNVNNATE
VKKVEAPTTSDVSKPKANEAVVTNESTKPKTTEAPTVNEESIAETPKTST
TQQDSTEKNNPSLKDNLNSSSTTSKESKTDEHSTKQAQMSTNKSNLDTND
SPTQSEKTSSQANNDSTDNQSAPSKQLDSKPSEQKVYKTKFNDEPTQDVE
HTTTKLKTPSVSTDSSVNDKQDYTRSAVASLGVDSNETEAITNAVRDNLD
LKAASREQINEAIIAEALKKDFSNPDYGVDTPLALNRSQSKNSPHKSASP
RMNLMSLAAEPNSGKNVNDKVKITNPTLSLNKSNNHANNVIWPTSNEQFN
LKANYELDDSIKEGDTFTIKYGQYIRPGGLELPAIKTQLRSKDGSIVANG
VYDKTTNTTTYTFTNYVDQYQNITGSFDLIATPKRETAIKDNQNYPMEVT
IANEVVKKDFIVDYGNKKDNTTTAAVANVDNVNNKHNEVVYLNQNNQNPK
YAKYFSTVKNGEFIPGEVKVYEVTDTNAMVDSFNPDLNSSNVKDVTSQFA
PKVSADGTRVDINFARSMANGKKYIVTQAVRPTGTGNVYTEYWLTRDGTT
NTNDFYRGTKSTTVTYLNGSSTAQGDNPTYSLGDYVWLDKNKNGVQDDDE
KGLAGVYVTLKDSNNRELQRVTTDQSGHYQFDNLQNGTYTVEFAIPDNYT
PSPANNSTNDAIDSDGERDGTRKVVVAKGTINNADNMTVDTGFYLTPKYN
VGDYVWEDTNKDGIQDDNEKGISGVKVTLKNKNGDTIGTTTTDSNGKYEF
TGLENGDYTIEFETPEGYTPTKQNSGSDEGKDSNGTKTTVTVKDADNKTI
DSGFYKPTYNLGDYVWEDTNKDGIQDDSEKGISGVKVTLKDKNGNAIGTT
TTDASGHYQFKGLENGSYTVEFETPSGYTPTKANSGQDITVDSNGITTTG
IINGADNLTIDSGFYKTPKYSVGDYVWEDTNKDGIQDDNEKGISGVKVTL
KDEKGNIISTTTTDENGKYQFDNLDSGNYIIHFEKPEGMTQTTANSGNDD
EKDADGEDVRVTITDHDDFSIDNGYFDDDSDSDSDADSDSDSDSDSDADS
DSDADSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDS
DADSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDS
DADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDADSDADSDSDADSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADS
DSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDKNAKDKLPDTGAN
EDHDSKGTLLGTLFAGLGALLLGRRRKKDNKEK
 ----+----1----+----2----+----3----+----4----+----5
Hydropathies  
 

© 2007-2017 Dr. Katja Kapp, Kassel & thpr.net e. K., Dresden, Germany, last update 2010-06-11